Sonic fête son anniversaire avec ses amis, un être mystérieux connu sous le nom Temps Eater apparaît soudainement, détruisant la partie et sucer tout le monde à travers différents «trous de temps", en les dispersant dans différents lieux de l'histoire. Sonic essaie de l'arrêter, mais le monstre l'assomme facilement. Après avoir repris conscience, Sonic se retrouve dans une étrange dimension appelé «espace blanc», un domaine où le temps et l'espace se retrouve après qu'il a été «effacées» en étant drainé de couleur et de vie. Comme Sonic cherche ses amis, il rencontre son jeune auto, Sonic Classic, avec un plus jeune, Tails classiques. Comme les deux queues de déterminer que les actions de Time Eater sont préjudiciables temps et l'espace lui-même, à la fois classique et moderne Sonic course à travers leur histoire, la restauration de temps à la normale et de sauver leurs amis.
Après restauration des mondes et la collecte de toutes les Chaos Emeralds, ils découvrent que le cerveau derrière l'heure Eater maintenant mis au point n'est autre que le Dr. Eggman.