Définir plusieurs années après la fin de Risen, des titans déchaînés ont dévasté le monde et poussé l'humanité au bord de l'existence. Par la suite, des créatures monstrueuses ont augmenté dans les profondeurs aquatiques de la mer et leurs attaques ont apporté tout marin à une halte de meulage. Le héros, désormais membre de l'Inquisition, est envoyé pour savoir comment arrêter le chaos causé par ces créatures de la profondeur. Sa quête commence par des rumeurs selon lesquelles les pirates qui fréquentent les îles du sud sont les seuls qui connaissent un moyen de se débarrasser de ces créatures une fois pour toutes et mettre fin à leur règne de terreur.
Avec un thème basé pirate-tout-nouveau, Risen 2: Dark Waters vise à combiner la mécanique classique des RPG de jeu les plus proches de l'original ressuscité avec un thème frais et mise sur une grande variété de lieux de l'île à thème. Une troisième personne jeu de rôle dans un univers sombre et dur, Risen 2: Dark Waters conserve les caractéristiques les plus immersifs de l'original ressuscité, avec de multiples approches pour chaque défi permettant aux joueurs de façonner le monde du jeu en fonction de leurs propres décisions. Ces choix permettront de débloquer de nouveaux chemins, les caractéristiques et les compétences supplémentaires pour le personnage.
