Far Cry 3 joueurs entrent dans la peau de Jason Brody, un homme seul au bord du monde, échoués sur une île tropicale mystérieuse coupés de la civilisation. Dans ce paradis sauvage où l'anarchie et la violence sont la seule chose sûre, les joueurs dicter quand, où et comment les événements du jeu se dérouler. Les joueurs vont réduire, se faufiler, exploser et tirer leur chemin à travers l'île dans un monde qui a perdu tout sens du bien et du mal.